Aunque creo que si no te pareció tan satisfactorio trabajar con la versión de IDE que te instaló, en lugar de hacer el programa directamente en proteus, puedes hacer el programa directamente en el IDE de arduino como se hace normalmente y luego de compilar tan solo cargas el archivo .hex al modelo de arduino en proteus, como si se estuviera trabajando con cualquier otro microcontrolador en proteus.
Como Descargar, Instalar Y Activar Proteus Professional 8.5 Librerias Arduino
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